香港衛生防護中心將于2009年底前設立傳染病通報電子平臺，增強定點監察系統偵測社區疫癥的功能。針對“風險前所未有地高”的艾滋病感染趨勢，防護中心除會于本年進行首項艾滋病感染個案的群組研究，更會設立艾滋病電子平臺，與珠三角地區13個城市交換感染數據。

據香港明報報道，香港衛生防護中心發表《防控傳染病策略計劃2007-09》，針對傳染病監測；肺癆、艾滋病病毒及性病監測；疫苗可預防疾病；及醫護環境感染情況等各方面，訂下一系列具體目標，當中計劃于09年底前設立傳染病通報監測電子平臺。中心亦會先于明年底引入“計算機化異常偵測方法”監察傳染病。

針對珠三角艾滋病病毒傳播的風險，防護中心更會推出多項策略，包括在本年進行首項艾滋病病毒感染者，及艾滋病患者的群組研究，明年底前亦會強化電子平臺，與珠三角地區13個城市交換艾滋病感染數據情報；就性病的社區監測，防護中心亦將加強性病伴侶呈報監察系統。

防護中心總監梁柏賢12日于立法會衛生事務委員會會議上表示，珠三角目前亦正就流感監測電子呈報作研究。除SARS、禽流感或流感大流行外，本港未來數年需特別注意的傳染病包括食物中毒(如O157:H7大腸桿菌)和EV-71腸病毒；經病媒傳播的登革熱、西尼羅河熱、日腦，甚至與生化恐怖活動相關的炭疽病。

至于疫苗可預防的疾病，防護中心未來數年的重要工作是要達到世衛定下，在2012“消除麻疹”和“控制乙型肝炎”的目標，其中香港目前的麻疹病發率仍高于世衛要求水平。梁柏賢亦稱，推行防疫注射減低傳染病風險。